生物数据整合与挖掘

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生物信息学应用计较机技术对各种生物数据进行办理和分析，以期发现生物数据所反应的生物纪律，促进生命科学的发展。一方面，生命科学实验发生的巨量的生物数据保存在世界各地的相关研究机构中，或隐含在浩大的科学文献里。另外一方面，生物信息学也希望采用数据挖掘技术对生物数据进行分析，以期发现生物纪律，因此根据生命科学的需要和范畴知识，设计出有效的生物数据挖掘算法和软件工具是一个重要的研究内容。
　　 本书较为系统地介绍了生物数据整合与挖掘的技术框架，主要介绍了作者在这方面的研究成果，包括：生物数据抽取技术、生物数据整合技术、生物序列数据挖掘、基因表达谱芯片数据挖掘、转录因子及顺式调控元件挖掘、生物数据模子和数据库办理系统等内容，还介绍了一个生物数据整合系统、一个基因表达谱芯片数据库和数据挖掘系统、一个转录因子及顺式调控元件的挖掘分析平台等等的设计与实现。
　　 本书的读者对象为从事生物信息学研究的科学工作者。
第1章背景知识
　　 诺贝尔奖获得者Dulbecc0于1986年在《Science》杂志上颁发的一篇短文中率先提出了人类基因组计划。该计划在探讨生命奥秘的过程中，使得自动化的DNA测序技术、生物数据挖掘分析技术、基因组数据库和分析软件、基因芯片技术的一些工具性技术获得了快速发展，并使生物信息学作为一个学科范畴获得了公认。本章介绍生物信息学、数据整合与数据挖掘方面的背景知识和根基概念。pdf格局电子书下载《生物数据整合与挖掘》的作者朱扬勇 熊赟和复旦年夜学出书社为本书的写作出书都付出了很多汗水。朱扬勇 熊赟完成生物数据整合与挖掘》在线免费阅读。1953年4月25日，Waston和Crick提出DNA双螺旋结构和自我复制机制，揭开了份子生物学研究的新篇章。它应用先进的数据办理技术、数学分析模子和计较机软件对各种生物数据进行提取、存储、处置和分析，旨在掌握复杂生命现象的形成模式与演化纪律。
　　1.1 生物信息学
　　 生命科学实验发生了年夜量生物数据，若何在数学、计较机科学等的支持下充分利用这些生物数据更有效地展开生命的探讨是一个很有意义的问题。1956年，在美国田纳西州盖特林堡召开首次“生物学中的信息理论研讨会”，萌生了生物信息学概念。70年月到80年月初，数学统计方法和计较机技术得到了较快发展，研究者起头应用计较机技术解决生物学问题，生物信息学初步形成。
　　 正如Dulbecc0 1986年所说：“人类的DNA序列是人类的真谛，这个世界上发生的一切事情，都与这一序列息息相关。其研究内容主要包括以下两年夜方面。今朝在国际上总共约有1 000多个生物数据库，存放数百TB的生物数据。文本方式对复杂的生物数据操作而言，处置效率是难以使人满意的，也即今朝的数据库技术都不适合生物数据的存储、办理和处置，这直接影响了生物信息学软件的有效性和实用性，进而影响了生命科学和生物技术的发展。其中，编码序列可被转录并执行一定的生物学功能；调控序列控制编码序列的动态行为，如转录调控序列控制编码序列的表达速率等。
　　 卵白质结构数据的分析和挖掘
　　 人类基因工程的目标之一是要了解人体内卵白质的结构、功能、相互感化以及与各种人类疾病之间的关系。在卵白质结构数据的分析和挖掘中，同源建模方法是具有代表性的方法。
　　 另外一个目标是从卵白质的氨基酸序列预测卵白质结构，即从头预测方法，根据物理、化学原理通过理论计较进行卵白质的结构预测。
　　 生物网络系统的分析和挖掘
　　 份子生物学研究揭露，复杂生命现象是年夜量基因活动且相互感化的结果。“DNA元件百科全书”计划的研究表明，人类基因组蓝图是一个复杂的网络系统。熟悉和解读人类基因组蓝图是后基因组时代生命科学范畴面临的最具挑战性的热门问题之一。系统生物学是研究生物系统中所有组成成分的构成，以及在特定条件下这些组分间的相互关系的学科，将在基因组序列的根本上完成由生物体内各种组成成分辨别及其相互感化的研究到途径、网络和模块的构建，这是现代生物学的研究前沿，已成为21世纪生物学的焦点驱动力。因此，有必要研究新的生物信息学方法，以对生物网络进行有效识别，从而为实验生物学研究提供重要的指导信息。朱扬勇，1963年生，浙江武义人。1994年于复旦年夜学获计较机软件专业理学博士学位。现为复旦年夜学计较机科学技术学院教授；上海市政府信息化专家；上海生物信息技术研究中心学术委员会委员；上海市计较机学会理事；上海市生物信息学会理事等。作为项目负责人，主持国家自然科学基金、“863计划”、上海市科委重点发展基金等10多项课题的研究工作。本站的pdf电子书《生物数据整合与挖掘》主要是由网络收集整理来的，最终著作权仍归属于原书的作者朱扬勇 熊赟和出版商。如果您喜欢这本书，请多多支持我们的图书出版事业，让辛苦写书的作者得到应有的回报。在此也要感谢复旦大学出版社，感谢出版社为《生物数据整合与挖掘》的出版所做的工作。本站只提供图书的试读版，同时欢迎更多的爱好读书的朋友来电子书下载网来分享更多好看的pdf电子书，免费下载您所需要的电子书籍。最后衷心感谢您下载《生物数据整合与挖掘》pdf版免费电子书。